Immer wieder finden sich Stationen im Dschungel mit deren Hilfe ihr euch an andere Orte teleportieren könnt. Diese haben jedoch noch eine weitere Funktion. Ihr dürft dort auch ein relativ simples, rundenbasiertes Strategiespiel um die Vorherrschaft auf dem Planeten starten. Es gilt dabei eure Truppen gekonnt zu platzieren um einzelne Gebiete Pandoras zu erobern und dadurch im eigentlichen Spiel Vorteile genießen zu können. So erhaltet ihr beispielsweise mehr Erfahrungspunkte oder stärkere Waffen. Letztendlich ist dies sicherlich eine gute Idee, das Spiel im Spiel selbst aber zu simpel und anspruchslos umgesetzt um dauerhaft zu motivieren. Nicht nur dass man sich irgendwie aus dem eigentlichen Geschehen herausgerissen fühlt, man benötigt auch die zusätzlichen Erfahrungspunkte nicht wirklich.
Des weiteren haben die Entwickler einen Multiplayer-Modus integriert, in dem sich bis zu 16 Spieler online miteinander messen können. Dieser umfasst 10 Maps, 5 recht traditionelle Modi und natürlich die zwei aus der Kampagne bekannten Fronten, zwischen denen ihr wählen könnt – sowie dieselben Designfehler des Einzelspieler-Modus.
